Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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