Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Sh3bp2Q06649 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp2Q06649 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms