Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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VdrP48281 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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VdrP48281 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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VdrP48281 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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VdrP48281 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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VdrP48281 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
VdrP48281 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
VdrP48281 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VdrP48281 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VdrP48281 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VdrP48281 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VdrP48281 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VdrP48281 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VdrP48281 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VdrP48281 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VdrP48281 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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