Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd10P28359 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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Hoxd10P28359 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd10P28359 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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