Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms