Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P10404 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
P10404 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms