Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TtrP07309 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TtrP07309 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TtrP07309 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TtrP07309 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TtrP07309 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TtrP07309 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TtrP07309 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TtrP07309 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm14473-201ENSMUST00000122269 557 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TtrP07309 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TtrP07309 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms