Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm24739-201ENSMUST00000158855 292 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm5829-201ENSMUST00000191383 351 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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Ccl20O89093 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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Ccl20O89093 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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Ccl20O89093 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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Ccl20O89093 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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Ccl20O89093 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr873-205ENSMUST00000215540 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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