Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm43814-201ENSMUST00000197851 413 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Gm379J3QQ19 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm23198-201ENSMUST00000158811 91 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm379J3QQ19 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms