Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms