Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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