Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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Col5a3Q9JLI2 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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Col5a3Q9JLI2 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr815-202ENSMUST00000216182 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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