Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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OtofQ9ESF1 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
OtofQ9ESF1 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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