Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms