Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
Cpne9Q1RLL3 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Cpne9Q1RLL3 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms