Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Perm1Q149B8 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms