Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 n-R5s220-201ENSMUST00000082926 120 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms