Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtprkP35822 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtprkP35822 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtprkP35822 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm22908-201ENSMUST00000177620 110 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm43829-201ENSMUST00000196191 3802 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtprkP35822 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtprkP35822 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprkP35822 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms