Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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