Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm23335-201ENSMUST00000117021 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm14473-201ENSMUST00000122269 557 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NebE9Q1W3 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
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