Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms