Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rtf1A2AQ19 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rtf1A2AQ19 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rtf1A2AQ19 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rtf1A2AQ19 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rtf1A2AQ19 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rtf1A2AQ19 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rtf1A2AQ19 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rtf1A2AQ19 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rtf1A2AQ19 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rtf1A2AQ19 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rtf1A2AQ19 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rtf1A2AQ19 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rtf1A2AQ19 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rtf1A2AQ19 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rtf1A2AQ19 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rtf1A2AQ19 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rtf1A2AQ19 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rtf1A2AQ19 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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