Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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Col5a3Q9JLI2 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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Col5a3Q9JLI2 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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Col5a3Q9JLI2 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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Col5a3Q9JLI2 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Col5a3Q9JLI2 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
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Col5a3Q9JLI2 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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Col5a3Q9JLI2 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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Col5a3Q9JLI2 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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Col5a3Q9JLI2 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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