Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Rnft1Q9DCN7 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Rnft1Q9DCN7 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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Rnft1Q9DCN7 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
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Rnft1Q9DCN7 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
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Rnft1Q9DCN7 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
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Rnft1Q9DCN7 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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Rnft1Q9DCN7 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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