Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RpainQ9CWY9 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms