Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.1 ms