Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Usp48Q3V0C5 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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Usp48Q3V0C5 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp48Q3V0C5 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms