Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms