Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
PtprmP28828 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PtprmP28828 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PtprmP28828 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
PtprmP28828 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
PtprmP28828 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
PtprmP28828 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
PtprmP28828 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PtprmP28828 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PtprmP28828 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PtprmP28828 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprmP28828 AC123035.1-201ENSMUST00000213846 2671 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprmP28828 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtprmP28828 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms