Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm29774-201ENSMUST00000219270 436 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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Ccl20O89093 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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Ccl20O89093 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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Ccl20O89093 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
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Ccl20O89093 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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Ccl20O89093 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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Ccl20O89093 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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