Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trpc5Q9QX29 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trpc5Q9QX29 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms