Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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