Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Rnft1Q9DCN7 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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Rnft1Q9DCN7 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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Rnft1Q9DCN7 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Rnft1Q9DCN7 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Rnft1Q9DCN7 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Rnft1Q9DCN7 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Rnft1Q9DCN7 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Rnft1Q9DCN7 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Rnft1Q9DCN7 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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