Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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Cntn3Q07409 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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Cntn3Q07409 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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Cntn3Q07409 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Cntn3Q07409 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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Cntn3Q07409 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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Cntn3Q07409 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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Cntn3Q07409 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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Cntn3Q07409 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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Cntn3Q07409 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cntn3Q07409 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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