Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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