Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
P10404 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
P10404 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
P10404 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
P10404 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
P10404 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
P10404 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
P10404 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
P10404 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
P10404 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
P10404 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
P10404 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
P10404 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
P10404 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
P10404 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
P10404 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
P10404 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
P10404 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
P10404 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms