Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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TtrP07309 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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TtrP07309 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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TtrP07309 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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TtrP07309 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm43829-201ENSMUST00000196191 3802 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TtrP07309 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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TtrP07309 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TtrP07309 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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TtrP07309 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TtrP07309 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TtrP07309 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TtrP07309 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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TtrP07309 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TtrP07309 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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TtrP07309 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TtrP07309 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TtrP07309 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TtrP07309 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TtrP07309 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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