Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Csmd3-209ENSMUST00000162830 13012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Zfp976-203ENSMUST00000187616 1908 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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Ccl20O89093 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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Ccl20O89093 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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Ccl20O89093 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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Ccl20O89093 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Obscn-203ENSMUST00000052872 23006 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccl20O89093 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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