Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BlmO88700 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BlmO88700 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BlmO88700 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BlmO88700 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BlmO88700 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BlmO88700 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BlmO88700 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BlmO88700 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BlmO88700 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BlmO88700 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BlmO88700 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BlmO88700 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BlmO88700 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BlmO88700 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BlmO88700 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BlmO88700 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BlmO88700 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BlmO88700 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BlmO88700 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BlmO88700 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BlmO88700 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BlmO88700 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BlmO88700 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BlmO88700 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BlmO88700 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
BlmO88700 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BlmO88700 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BlmO88700 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BlmO88700 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BlmO88700 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BlmO88700 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BlmO88700 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BlmO88700 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BlmO88700 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BlmO88700 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BlmO88700 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BlmO88700 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BlmO88700 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BlmO88700 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BlmO88700 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BlmO88700 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BlmO88700 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BlmO88700 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BlmO88700 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BlmO88700 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BlmO88700 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BlmO88700 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BlmO88700 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BlmO88700 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BlmO88700 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BlmO88700 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BlmO88700 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms