Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Abcc1O35379 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Gm5829-201ENSMUST00000191383 351 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Abcc1O35379 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms