Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp29Q9ES63 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms