Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm11281-201ENSMUST00000141391 576 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms