Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Clcn1Q64347 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms