Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms