Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Mkrn3Q60764 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms