Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Ccndbp1Q3TVC7 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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