Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtpreP49446 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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PtpreP49446 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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PtpreP49446 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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PtpreP49446 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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PtpreP49446 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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PtpreP49446 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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PtpreP49446 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtpreP49446 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtpreP49446 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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PtpreP49446 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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PtpreP49446 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpreP49446 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpreP49446 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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