Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr716-207ENSMUST00000216871 4062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms