Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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Col5a3Q9JLI2 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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Col5a3Q9JLI2 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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Col5a3Q9JLI2 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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