Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Btbd35f10-201ENSMUST00000178621 1952 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Cep295-208ENSMUST00000161132 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Vwc2l-203ENSMUST00000161937 4323 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc47Q9D024 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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